Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TNXAQ16473 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNXAQ16473 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms