Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
CCDC6Q16204 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CCDC6Q16204 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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