Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
USF2Q15853 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
USF2Q15853 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
USF2Q15853 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
USF2Q15853 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
USF2Q15853 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.72□□□□□ -2.52
USF2Q15853 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
USF2Q15853 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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