Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
SS18Q15532 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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SS18Q15532 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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SS18Q15532 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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SS18Q15532 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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SS18Q15532 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SS18Q15532 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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