Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIV2LQ15477 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
SKIV2LQ15477 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SKIV2LQ15477 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SKIV2LQ15477 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SKIV2LQ15477 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SKIV2LQ15477 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SKIV2LQ15477 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SKIV2LQ15477 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SKIV2LQ15477 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SKIV2LQ15477 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
SKIV2LQ15477 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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