Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RAB39AQ14964 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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RAB39AQ14964 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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RAB39AQ14964 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RAB39AQ14964 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RAB39AQ14964 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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