Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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GBX1Q14549 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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GBX1Q14549 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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GBX1Q14549 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
GBX1Q14549 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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GBX1Q14549 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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GBX1Q14549 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
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GBX1Q14549 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
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GBX1Q14549 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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GBX1Q14549 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
GBX1Q14549 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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GBX1Q14549 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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GBX1Q14549 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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GBX1Q14549 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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GBX1Q14549 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
GBX1Q14549 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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