Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NEDD9Q14511 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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NEDD9Q14511 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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NEDD9Q14511 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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NEDD9Q14511 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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NEDD9Q14511 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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NEDD9Q14511 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NEDD9Q14511 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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