Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCARF1Q14162 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SCARF1Q14162 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SCARF1Q14162 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARF1Q14162 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARF1Q14162 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARF1Q14162 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARF1Q14162 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARF1Q14162 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARF1Q14162 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCARF1Q14162 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCARF1Q14162 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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