Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-1.76□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
COL4A6Q14031 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
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COL4A6Q14031 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
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COL4A6Q14031 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.83□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.83□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
COL4A6Q14031 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
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