Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
CACNA1SQ13698 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CACNA1SQ13698 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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