Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RIPK1Q13546 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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