Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TUBB3Q13509 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.2 ms