Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TRIM28Q13263 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TRIM28Q13263 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
TRIM28Q13263 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.59□□□□□ -2
TRIM28Q13263 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TRIM28Q13263 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TRIM28Q13263 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM28Q13263 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM28Q13263 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM28Q13263 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM28Q13263 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRIM28Q13263 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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