Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CBX3Q13185 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CBX3Q13185 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CBX3Q13185 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CBX3Q13185 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CBX3Q13185 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CBX3Q13185 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CBX3Q13185 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CBX3Q13185 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CBX3Q13185 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CBX3Q13185 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CBX3Q13185 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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