Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KCNMA1Q12791 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
KCNMA1Q12791 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
KCNMA1Q12791 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KCNMA1Q12791 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KCNMA1Q12791 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KCNMA1Q12791 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KCNMA1Q12791 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KCNMA1Q12791 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
KCNMA1Q12791 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.4 ms