Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ANKRD28O15084 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ANKRD28O15084 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.1 ms