Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
SMG1Q96Q15 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.97□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
SMG1Q96Q15 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
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