Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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RTN1Q16799 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
RTN1Q16799 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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RTN1Q16799 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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RTN1Q16799 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
RTN1Q16799 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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RTN1Q16799 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RTN1Q16799 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RTN1Q16799 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RTN1Q16799 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RTN1Q16799 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RTN1Q16799 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RTN1Q16799 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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RTN1Q16799 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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