Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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CTF1Q16619 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CTF1Q16619 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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CTF1Q16619 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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CTF1Q16619 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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CTF1Q16619 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
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CTF1Q16619 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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CTF1Q16619 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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CTF1Q16619 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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CTF1Q16619 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
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CTF1Q16619 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTF1Q16619 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
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