Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SF1Q15637 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SF1Q15637 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF1Q15637 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF1Q15637 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF1Q15637 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF1Q15637 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SF1Q15637 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SF1Q15637 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF1Q15637 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF1Q15637 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF1Q15637 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SF1Q15637 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF1Q15637 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SF1Q15637 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF1Q15637 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF1Q15637 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF1Q15637 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF1Q15637 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SF1Q15637 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SF1Q15637 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SF1Q15637 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SF1Q15637 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SF1Q15637 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SF1Q15637 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SF1Q15637 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
SF1Q15637 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SF1Q15637 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SF1Q15637 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SF1Q15637 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SF1Q15637 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SF1Q15637 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SF1Q15637 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SF1Q15637 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SF1Q15637 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SF1Q15637 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SF1Q15637 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SF1Q15637 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SF1Q15637 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SF1Q15637 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SF1Q15637 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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