Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SEC23AQ15436 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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SEC23AQ15436 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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SEC23AQ15436 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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SEC23AQ15436 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
SEC23AQ15436 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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SEC23AQ15436 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
SEC23AQ15436 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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