Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNX17Q15036 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SNX17Q15036 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms