Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-2.18□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SHPRHQ149N8 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SHPRHQ149N8 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SHPRHQ149N8 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
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