Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SCARF1Q14162 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SCARF1Q14162 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.6 ms