Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ITGA9Q13797 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ITGA9Q13797 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms