Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CUL1Q13616 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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CUL1Q13616 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
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CUL1Q13616 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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CUL1Q13616 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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CUL1Q13616 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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CUL1Q13616 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CUL1Q13616 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CUL1Q13616 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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