Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SNX1Q13596 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
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SNX1Q13596 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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SNX1Q13596 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
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SNX1Q13596 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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SNX1Q13596 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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SNX1Q13596 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SNX1Q13596 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
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SNX1Q13596 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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