Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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TUBB3Q13509 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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TUBB3Q13509 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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TUBB3Q13509 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TUBB3Q13509 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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TUBB3Q13509 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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TUBB3Q13509 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TUBB3Q13509 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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