Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TOP3AQ13472 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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TOP3AQ13472 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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