Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
XRCC4Q13426 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
XRCC4Q13426 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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