Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTK7Q13308 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTK7Q13308 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTK7Q13308 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTK7Q13308 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTK7Q13308 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTK7Q13308 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTK7Q13308 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PTK7Q13308 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTK7Q13308 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTK7Q13308 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTK7Q13308 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTK7Q13308 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTK7Q13308 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTK7Q13308 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PTK7Q13308 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTK7Q13308 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTK7Q13308 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTK7Q13308 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PTK7Q13308 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTK7Q13308 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTK7Q13308 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTK7Q13308 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTK7Q13308 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PTK7Q13308 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTK7Q13308 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PTK7Q13308 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTK7Q13308 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTK7Q13308 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTK7Q13308 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
PTK7Q13308 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PTK7Q13308 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTK7Q13308 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTK7Q13308 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTK7Q13308 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTK7Q13308 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTK7Q13308 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTK7Q13308 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTK7Q13308 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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