Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NME3Q13232 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NME3Q13232 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NME3Q13232 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NME3Q13232 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
NME3Q13232 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NME3Q13232 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NME3Q13232 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NME3Q13232 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NME3Q13232 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NME3Q13232 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NME3Q13232 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NME3Q13232 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NME3Q13232 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NME3Q13232 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NME3Q13232 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NME3Q13232 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NME3Q13232 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NME3Q13232 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NME3Q13232 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NME3Q13232 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NME3Q13232 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NME3Q13232 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NME3Q13232 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NME3Q13232 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NME3Q13232 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NME3Q13232 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NME3Q13232 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NME3Q13232 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NME3Q13232 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NME3Q13232 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
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