Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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IFT88Q13099 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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IFT88Q13099 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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IFT88Q13099 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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IFT88Q13099 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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IFT88Q13099 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
IFT88Q13099 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
IFT88Q13099 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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