Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HCN4Q9Y3Q4 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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HCN4Q9Y3Q4 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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HCN4Q9Y3Q4 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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HCN4Q9Y3Q4 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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HCN4Q9Y3Q4 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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HCN4Q9Y3Q4 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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HCN4Q9Y3Q4 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN4Q9Y3Q4 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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HCN4Q9Y3Q4 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HCN4Q9Y3Q4 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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