Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SH3BP4Q9P0V3 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SH3BP4Q9P0V3 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
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