Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
PDGFDQ9GZP0 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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