Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXQ1Q9C009 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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