Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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CHSY3Q70JA7 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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CHSY3Q70JA7 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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CHSY3Q70JA7 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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CHSY3Q70JA7 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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CHSY3Q70JA7 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CHSY3Q70JA7 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
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