Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
USP43Q70EL4 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
USP43Q70EL4 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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