Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
SWI5Q1ZZU3 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SWI5Q1ZZU3 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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