Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
HIF1AQ16665 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HIF1AQ16665 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
HIF1AQ16665 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HIF1AQ16665 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HIF1AQ16665 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HIF1AQ16665 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HIF1AQ16665 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HIF1AQ16665 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HIF1AQ16665 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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