Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMN1Q16637 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMN1Q16637 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.3 ms