Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDCD1Q15116 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDCD1Q15116 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDCD1Q15116 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDCD1Q15116 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDCD1Q15116 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDCD1Q15116 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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