Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
RAB3GAP1Q15042 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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