Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CAPRIN1Q14444 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CAPRIN1Q14444 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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