Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCINQ13939 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCINQ13939 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCINQ13939 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCINQ13939 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCINQ13939 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CCINQ13939 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCINQ13939 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCINQ13939 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCINQ13939 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCINQ13939 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCINQ13939 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCINQ13939 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCINQ13939 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CCINQ13939 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CCINQ13939 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCINQ13939 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCINQ13939 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCINQ13939 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CCINQ13939 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCINQ13939 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CCINQ13939 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCINQ13939 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCINQ13939 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCINQ13939 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CCINQ13939 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CCINQ13939 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCINQ13939 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCINQ13939 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CCINQ13939 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CCINQ13939 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCINQ13939 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCINQ13939 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCINQ13939 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CCINQ13939 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CCINQ13939 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CCINQ13939 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCINQ13939 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCINQ13939 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCINQ13939 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCINQ13939 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CCINQ13939 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CCINQ13939 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCINQ13939 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCINQ13939 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCINQ13939 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCINQ13939 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCINQ13939 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCINQ13939 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CCINQ13939 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CCINQ13939 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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