Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TUBA3CQ13748 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TUBA3CQ13748 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.2 ms