Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
DNASE1L3Q13609 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
DNASE1L3Q13609 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
DNASE1L3Q13609 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms