Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
TOP3AQ13472 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TOP3AQ13472 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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